赤潮毒素主要由赤潮生物甲藻、裸甲藻和夜光藻产生的藻毒素。裸甲藻和甲藻能排泄化学成分非常稳定的甲藻毒素，这些毒素可分为神经性贝毒甲藻素、麻木性贝毒素和溶血性贝毒素，对动物的心肌呼吸和神经中枢起阻止效果，或具有溶血效果。

　　夜光藻是一种损害很大的有毒赤潮藻类，它主要是排泄神经毒素，对鱼虾的呼吸系统有毒性和抑制效果。有夜光藻的水体，一般都会伴有荧光弧菌等病害，如果不及时处理，就会引起很多偷死，终失利排塘。

　　主要由铜绿微囊藻、水华鱼腥藻和颤藻所产生的微囊藻毒素。微囊藻毒素一般产生并存在于蓝藻细胞内，当蓝藻的细胞衰老、死亡和破裂时才会释放到水中，不仅损坏肝细胞的结构，一起在肠胃中生存，是造成对虾空肠空胃、肝胰腺萎缩的直接原因。

　　对虾饲养前期，虾苗吃到藻毒素则中毒，吃料下降甚至不吃料、靠边慢游、肝胰腺产生病变，然后很多死亡。饲养中后期，池塘产生"倒藻"或人为灭藻，有毒有害藻很多死亡，藻毒素构成威迫，随后继发病原病菌，对虾出现严峻偷死。