蓝藻属蓝藻门分为两纲：色球藻纲和藻殖段纲。色球藻纲藻体为单细胞体或集体；藻殖段纲藻体为丝状体，有藻殖段。蓝藻在地球上大约出现在距今35~33亿年前，已知蓝藻约2000种，中国已有记录的约900种。散布十分广泛。

　　遍及世界各地，但大多数（约75%）淡水产，少量海产；有些蓝藻可生活在60~85℃的温泉中；有些种类和菌、苔藓、蕨类和裸子植物共生；有些还可穿入钙质岩石或介壳中（如穿钙藻类）或土壤深层中（如土壤蓝藻）。

　　蓝藻是单细胞生物，没有细胞核，但细胞中央含有核物质，通常呈颗粒状或网状，染色体和色素均匀的散布在细胞质中。该核物质没有核膜和核仁，但具有核的功能，故称其为原核。和细菌一样，蓝藻归于"原核生物".它和具原核的细菌等一起，单立为原核生物界。

　　蓝藻不具叶绿体、线粒体、高尔基体、内质网和液泡等细胞器，含叶绿素a,无叶绿素b,含数种叶黄素和胡萝卜素，还含有藻胆素（是藻红素、藻蓝素和别藻蓝素的总称）。一般说，凡含叶绿素a和藻蓝素量较大的，细胞大多呈蓝绿色。相同，也有少量种类含有较多的藻。