蓝藻是原核生物，又叫蓝绿藻 蓝细菌；大多数蓝藻的细胞壁外面有胶质衣，因而又叫粘藻。在一切藻类生物中，蓝藻是简单、原始的一种。蓝藻是单细胞生物，没有细胞核，但细胞中心含有核物质。

　　通常呈颗粒状或网状，染色质和色素均匀的分布在细胞质中。该核物质没有核膜和核仁，但具有核的功能，故称其为原核（或拟核）。在蓝藻中还有一种环状DNA--质粒，在基因工程中担当了运载体的效果。

　　和细菌一样，蓝藻属于"原核生物".它和具原核的细菌等一起，单立为原核生物界。一切的蓝藻都含有一种特殊的蓝色色素，蓝藻便是因而得名。可是蓝藻也不全是蓝色的。

　　不同的蓝藻含有一些不同的色素，有的含叶绿素，有的含有蓝藻叶黄素，有的含有胡萝卜素，有的含有蓝藻藻蓝素，也有的含有蓝藻藻红素。红海便是因为水中含有大量藻红素的蓝藻，使海水呈现出赤色。