"水华"的防控，主要是截污治污，操控污水入河，防止水土流失，阻止营养物质经过径流、渗入等方式进入水体。防治水华的措施还包含物理技能、化学技能、生物技能等办法。其中物理技能有疏浚底泥、稀释冲刷、人工循环和消除滞水层等。

　　化学技能主要是指经过运用化学药剂如硫酸铜、大麦秆等进行除藻；生物技能便是使用藻类植物和其他生物操控水体中的营养物质，抑制藻类过量繁殖，树立生态平衡系统，或许使用基因工程操控藻类生长。某些处理措施在理论上或许在必定的条件下是可行的。

　　但是在实际上或许在大范围内，则往往达不到预期的效果，都存在必定的局限性。物理办法见效快，但本钱高、不经济，不能从根本上排除营养成分对藻类的刺激作用。比如曝气增氧设备，要求动力大、费用高，对小水体比较有用。

　　解层混合只在深度是透光区水深两倍以上的水体中才有用；水位调节不易操控，在水资源紧缺情况下，很多引水冲刷不可取；收藻设备受动力和活动范围的影响较大；底泥疏浚可能因为提高水中的有用氮磷浓度而利于藻类的增殖等。