蓝藻具固氮酶系一般藻类能够直接吸收使用的有用氮，在养殖水体中有NH3或N、N、N几种形状。当这些有用氮缺少时，蓝藻能够直接吸收使用融入水中的氮气，人们把这部分蓝藻称为固氮蓝藻，固氮主要在蓝藻异形胞内进行。

　　所以说氮成为藻类成长的约束因子时，其他藻类的成长受到约束，而蓝藻将迅速成为优势藻类。尽管正常池塘环境下有用氮源并不缺少，但在晴朗天气条件下，因为水温分层导致上下水层难以交流，上表水层藻类增殖旺盛，耗费大量氮源，中下层氮源难以补充到光照层，此时就会呈现局部有用氮元素缺少的现象。

　　蓝藻具伪空泡 又称假空泡。伪空泡可调理藻类在水体中浮力，在上午太阳出来之后，蓝藻可凭借伪空泡的浮力效果快速上浮到上表水层即佳光合效果光照强度的位置，有利于争夺光源。在夏秋高温时节，光照较强时，藻类增殖旺盛。

　　耗费着大量的营养元素，致使上表水层的光照层，呈现高水温、高pH的同时，呈现局部营养元素缺少的现象。因为蓝藻具有上述显着的竞赛优势，致使其他藻类无法与蓝藻竞赛，难以成长，使蓝藻"一藻独大",这就是蓝藻水华的前期。